資產評估的科學性與準確性，決定其能夠作為認定商業秘密損害賠償額的有效方式。但在司法審判與知識產權資產評估的結合過程中，明確評估標準、規范評估行為仍是需要探索和完善的內容。
權利人實際損失的計算：實踐中權利人主張實際損失，主要依據自身的研發成本、減少的訂單數量×平均利潤等。直接依據技術秘密研發成本主張實際損失，一般難以得到支持。權利人實際損失，實際上是指權利人預期收益數額，即若無被告的侵權行為，原告本可獲得的利潤。如原告無證據證明其因被告侵權行為而失去的訂單數量，一般可推定侵權行為人新增訂單源自權利人因侵權行為失去的訂單，權利人可依據侵權行為人訂單數量和行業平均利潤主張賠償額。如果證據確鑿可信，甚至可依據權利人的利潤率確定。但對權利人的舉證水平有較高要求，對于銷售數量、價格、利潤率等均須有比較明確、直接的證據。
這種計算方式存在有兩個問題：一是減少的訂單數量與市場需求直接相關，涉及的影響因素很多，有時訂單不但沒有減少，反而還有增加，也就是說權利人的收益增加了；二是平均利潤，權利人主張的平均利潤與侵權人獲利中的平均利潤，往往存在有很大差距。
侵權人侵權獲利的計算：從司法實踐看，證明實際損失難度較高，以侵權獲利來確定賠償數額相對容易，因侵權獲利證據相對而言較易獲得，如：侵權產品銷售量×行業平均利潤率。鑒于目前我國許多中小企業會計管理制度不完善，權利人要想獲取相關的財務數據，困難很大。證明侵權獲利還需要證明涉案商業秘密在企業經營獲利中貢獻率的相應證據。因侵權人的利潤有多種來源，一般難以認定侵權人經營所獲利潤都來源于爭議的商業秘密。
這種計算方式面臨的問題：一是能否獲取完整的侵權人會計管理數據，成為評估侵權人侵權獲利的關鍵；二是侵權人獲利來源與爭議的商業秘密是否有直接關系。
法官的法定賠償：由于舉證的問題，當前多數商業秘密侵權案件運用法定賠償方法確定賠償數額，同時，在一定程度上導致賠償數額偏低。司法實踐中，如果權利人能夠提供其實際損失，或被告侵權獲利的證據，至少可以據此計算出銷售額或利潤總額等的基本數字，使后續的酌定有所依據，可以為法.院在法定限額賠償中參考。在商業秘密刑.事保護中，需要對侵.犯商業秘密的侵權行為給權利人造成的經濟損失，或者侵權人的獲利進行評估。只有當權利人的經濟損失，或者侵權人的獲利超過50萬元，才有可能構成刑.事案件。因此，公.安機關在辦理商業秘密刑.事案件時，對證據的收集就顯得尤其重要。
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